Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SUDS3Q9H7L9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms