Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNCQ9H7C4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms