Protein–RNA interactions for Protein: Q9H772

GREM2, Gremlin-2, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREM2Q9H772 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GREM2Q9H772 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GREM2Q9H772 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GREM2Q9H772 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GREM2Q9H772 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GREM2Q9H772 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GREM2Q9H772 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GREM2Q9H772 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GREM2Q9H772 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GREM2Q9H772 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GREM2Q9H772 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GREM2Q9H772 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GREM2Q9H772 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GREM2Q9H772 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GREM2Q9H772 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GREM2Q9H772 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GREM2Q9H772 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GREM2Q9H772 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GREM2Q9H772 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GREM2Q9H772 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GREM2Q9H772 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GREM2Q9H772 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GREM2Q9H772 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GREM2Q9H772 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GREM2Q9H772 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GREM2Q9H772 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GREM2Q9H772 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GREM2Q9H772 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GREM2Q9H772 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GREM2Q9H772 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GREM2Q9H772 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
GREM2Q9H772 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GREM2Q9H772 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GREM2Q9H772 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GREM2Q9H772 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GREM2Q9H772 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GREM2Q9H772 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms