Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REEP4Q9H6H4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REEP4Q9H6H4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms