Protein–RNA interactions for Protein: Q9H611

PIF1, ATP-dependent DNA helicase PIF1, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIF1Q9H611 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIF1Q9H611 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIF1Q9H611 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms