Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 AL590133.2-202ENST00000561111 642 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
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