Protein–RNA interactions for Protein: Q9H270

VPS11, Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS11Q9H270 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
VPS11Q9H270 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS11Q9H270 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms