Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0C3

TMEM117, Transmembrane protein 117, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM117Q9H0C3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMEM117Q9H0C3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM117Q9H0C3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms