Protein–RNA interactions for Protein: Q9H009

NACA2, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACA2Q9H009 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NACA2Q9H009 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NACA2Q9H009 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NACA2Q9H009 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NACA2Q9H009 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NACA2Q9H009 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NACA2Q9H009 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NACA2Q9H009 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NACA2Q9H009 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NACA2Q9H009 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NACA2Q9H009 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NACA2Q9H009 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NACA2Q9H009 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NACA2Q9H009 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NACA2Q9H009 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NACA2Q9H009 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NACA2Q9H009 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NACA2Q9H009 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NACA2Q9H009 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NACA2Q9H009 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NACA2Q9H009 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NACA2Q9H009 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NACA2Q9H009 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NACA2Q9H009 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NACA2Q9H009 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
NACA2Q9H009 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NACA2Q9H009 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NACA2Q9H009 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NACA2Q9H009 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NACA2Q9H009 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NACA2Q9H009 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NACA2Q9H009 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NACA2Q9H009 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NACA2Q9H009 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NACA2Q9H009 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NACA2Q9H009 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NACA2Q9H009 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NACA2Q9H009 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NACA2Q9H009 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NACA2Q9H009 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NACA2Q9H009 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NACA2Q9H009 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NACA2Q9H009 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NACA2Q9H009 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NACA2Q9H009 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NACA2Q9H009 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms