Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NIF3L1Q9GZT8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NIF3L1Q9GZT8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NIF3L1Q9GZT8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NIF3L1Q9GZT8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIF3L1Q9GZT8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms