Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL6

PRKD2, Serine/threonine-protein kinase D2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD2Q9BZL6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRKD2Q9BZL6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKD2Q9BZL6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms