Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BARHL1Q9BZE3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BARHL1Q9BZE3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BARHL1Q9BZE3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BARHL1Q9BZE3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BARHL1Q9BZE3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BARHL1Q9BZE3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BARHL1Q9BZE3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BARHL1Q9BZE3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms