Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM54Q9BYV2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM54Q9BYV2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms