Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYU1

PBX4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX4Q9BYU1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBX4Q9BYU1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBX4Q9BYU1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBX4Q9BYU1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBX4Q9BYU1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBX4Q9BYU1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PBX4Q9BYU1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PBX4Q9BYU1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PBX4Q9BYU1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PBX4Q9BYU1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PBX4Q9BYU1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PBX4Q9BYU1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PBX4Q9BYU1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PBX4Q9BYU1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PBX4Q9BYU1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PBX4Q9BYU1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PBX4Q9BYU1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBX4Q9BYU1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBX4Q9BYU1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBX4Q9BYU1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBX4Q9BYU1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBX4Q9BYU1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBX4Q9BYU1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PBX4Q9BYU1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBX4Q9BYU1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBX4Q9BYU1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBX4Q9BYU1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBX4Q9BYU1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBX4Q9BYU1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PBX4Q9BYU1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PBX4Q9BYU1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PBX4Q9BYU1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PBX4Q9BYU1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PBX4Q9BYU1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PBX4Q9BYU1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PBX4Q9BYU1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms