Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TDRD1Q9BXT4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms