Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF7Q9BWX1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF7Q9BWX1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF7Q9BWX1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF7Q9BWX1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF7Q9BWX1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF7Q9BWX1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF7Q9BWX1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF7Q9BWX1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF7Q9BWX1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF7Q9BWX1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF7Q9BWX1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF7Q9BWX1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF7Q9BWX1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF7Q9BWX1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF7Q9BWX1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF7Q9BWX1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF7Q9BWX1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF7Q9BWX1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF7Q9BWX1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF7Q9BWX1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF7Q9BWX1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF7Q9BWX1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF7Q9BWX1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF7Q9BWX1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF7Q9BWX1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF7Q9BWX1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF7Q9BWX1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF7Q9BWX1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF7Q9BWX1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF7Q9BWX1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF7Q9BWX1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF7Q9BWX1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF7Q9BWX1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF7Q9BWX1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF7Q9BWX1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF7Q9BWX1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF7Q9BWX1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF7Q9BWX1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF7Q9BWX1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF7Q9BWX1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms