Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWV2

SPATA9, Spermatogenesis-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA9Q9BWV2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPATA9Q9BWV2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPATA9Q9BWV2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPATA9Q9BWV2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPATA9Q9BWV2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPATA9Q9BWV2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPATA9Q9BWV2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPATA9Q9BWV2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPATA9Q9BWV2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPATA9Q9BWV2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPATA9Q9BWV2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPATA9Q9BWV2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPATA9Q9BWV2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPATA9Q9BWV2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms