Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVM4

GGACT, Gamma-glutamylaminecyclotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGACTQ9BVM4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GGACTQ9BVM4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GGACTQ9BVM4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms