Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF4Q9BUZ4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms