Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUV0

RSRP1, Arginine/serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSRP1Q9BUV0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSRP1Q9BUV0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms