Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR3CQ9BUI4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3CQ9BUI4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms