Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV3

SLC50A1, Sugar transporter SWEET1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC50A1Q9BRV3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC50A1Q9BRV3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC50A1Q9BRV3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC50A1Q9BRV3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC50A1Q9BRV3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC50A1Q9BRV3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC50A1Q9BRV3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC50A1Q9BRV3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC50A1Q9BRV3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC50A1Q9BRV3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC50A1Q9BRV3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC50A1Q9BRV3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC50A1Q9BRV3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC50A1Q9BRV3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC50A1Q9BRV3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC50A1Q9BRV3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC50A1Q9BRV3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC50A1Q9BRV3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC50A1Q9BRV3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC50A1Q9BRV3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC50A1Q9BRV3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC50A1Q9BRV3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC50A1Q9BRV3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC50A1Q9BRV3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC50A1Q9BRV3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms