Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CPPED1Q9BRF8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPPED1Q9BRF8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms