Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ZNF559Q9BR84 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZNF559Q9BR84 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF559Q9BR84 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF559Q9BR84 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF559Q9BR84 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF559Q9BR84 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF559Q9BR84 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF559Q9BR84 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF559Q9BR84 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF559Q9BR84 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF559Q9BR84 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF559Q9BR84 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF559Q9BR84 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF559Q9BR84 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF559Q9BR84 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF559Q9BR84 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF559Q9BR84 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF559Q9BR84 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF559Q9BR84 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF559Q9BR84 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF559Q9BR84 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF559Q9BR84 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF559Q9BR84 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF559Q9BR84 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF559Q9BR84 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF559Q9BR84 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF559Q9BR84 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF559Q9BR84 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF559Q9BR84 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF559Q9BR84 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF559Q9BR84 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF559Q9BR84 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF559Q9BR84 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF559Q9BR84 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF559Q9BR84 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF559Q9BR84 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms