Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOXF2Q9BQY4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOXF2Q9BQY4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms