Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMCHL2Q9BQD1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms