Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ90

KLHDC3, Kelch domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC3Q9BQ90 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHDC3Q9BQ90 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHDC3Q9BQ90 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHDC3Q9BQ90 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHDC3Q9BQ90 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHDC3Q9BQ90 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHDC3Q9BQ90 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHDC3Q9BQ90 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHDC3Q9BQ90 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHDC3Q9BQ90 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHDC3Q9BQ90 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHDC3Q9BQ90 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHDC3Q9BQ90 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHDC3Q9BQ90 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHDC3Q9BQ90 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHDC3Q9BQ90 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
KLHDC3Q9BQ90 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
KLHDC3Q9BQ90 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms