Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ04

RBM4B, RNA-binding protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4BQ9BQ04 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RBM4BQ9BQ04 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms