Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
MEIS3Q99687 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MEIS3Q99687 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms