Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MMP19Q99542 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MMP19Q99542 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MMP19Q99542 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
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