Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYCBPQ99417 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYCBPQ99417 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYCBPQ99417 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYCBPQ99417 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYCBPQ99417 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYCBPQ99417 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYCBPQ99417 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYCBPQ99417 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYCBPQ99417 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYCBPQ99417 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYCBPQ99417 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYCBPQ99417 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYCBPQ99417 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYCBPQ99417 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYCBPQ99417 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYCBPQ99417 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYCBPQ99417 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYCBPQ99417 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYCBPQ99417 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MYCBPQ99417 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MYCBPQ99417 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MYCBPQ99417 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MYCBPQ99417 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MYCBPQ99417 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MYCBPQ99417 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MYCBPQ99417 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MYCBPQ99417 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MYCBPQ99417 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MYCBPQ99417 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MYCBPQ99417 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MYCBPQ99417 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYCBPQ99417 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms