Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
YME1L1Q96TA2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
YME1L1Q96TA2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
YME1L1Q96TA2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
YME1L1Q96TA2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YME1L1Q96TA2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YME1L1Q96TA2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
YME1L1Q96TA2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
YME1L1Q96TA2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
YME1L1Q96TA2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
YME1L1Q96TA2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
YME1L1Q96TA2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
YME1L1Q96TA2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
YME1L1Q96TA2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
YME1L1Q96TA2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms