Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB8

SMC6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC6Q96SB8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMC6Q96SB8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC6Q96SB8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms