Protein–RNA interactions for Protein: Q96S59

RANBP9, Ran-binding protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP9Q96S59 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANBP9Q96S59 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANBP9Q96S59 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANBP9Q96S59 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANBP9Q96S59 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANBP9Q96S59 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANBP9Q96S59 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANBP9Q96S59 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RANBP9Q96S59 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RANBP9Q96S59 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RANBP9Q96S59 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RANBP9Q96S59 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RANBP9Q96S59 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RANBP9Q96S59 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RANBP9Q96S59 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RANBP9Q96S59 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RANBP9Q96S59 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RANBP9Q96S59 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RANBP9Q96S59 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RANBP9Q96S59 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RANBP9Q96S59 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RANBP9Q96S59 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RANBP9Q96S59 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RANBP9Q96S59 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RANBP9Q96S59 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RANBP9Q96S59 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RANBP9Q96S59 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RANBP9Q96S59 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RANBP9Q96S59 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RANBP9Q96S59 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RANBP9Q96S59 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RANBP9Q96S59 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RANBP9Q96S59 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RANBP9Q96S59 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANBP9Q96S59 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms