Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CICQ96RK0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CICQ96RK0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CICQ96RK0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms