Protein–RNA interactions for Protein: Q96P64

AGAP4, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP4Q96P64 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP4Q96P64 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP4Q96P64 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP4Q96P64 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP4Q96P64 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP4Q96P64 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP4Q96P64 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP4Q96P64 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP4Q96P64 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP4Q96P64 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP4Q96P64 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP4Q96P64 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.33■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP4Q96P64 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AGAP4Q96P64 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
AGAP4Q96P64 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AGAP4Q96P64 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AGAP4Q96P64 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP4Q96P64 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP4Q96P64 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP4Q96P64 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP4Q96P64 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP4Q96P64 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP4Q96P64 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP4Q96P64 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP4Q96P64 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP4Q96P64 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP4Q96P64 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP4Q96P64 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP4Q96P64 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP4Q96P64 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP4Q96P64 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP4Q96P64 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP4Q96P64 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP4Q96P64 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP4Q96P64 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP4Q96P64 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP4Q96P64 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP4Q96P64 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP4Q96P64 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP4Q96P64 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP4Q96P64 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP4Q96P64 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP4Q96P64 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP4Q96P64 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP4Q96P64 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms