Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF396Q96N95 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF396Q96N95 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms