Protein–RNA interactions for Protein: Q96MS0

ROBO3, Roundabout homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO3Q96MS0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ROBO3Q96MS0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ROBO3Q96MS0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms