Protein–RNA interactions for Protein: Q96MM3

ZFP42, Zinc finger protein 42 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP42Q96MM3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZFP42Q96MM3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZFP42Q96MM3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms