Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FAM227BQ96M60 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM227BQ96M60 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM227BQ96M60 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM227BQ96M60 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM227BQ96M60 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM227BQ96M60 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM227BQ96M60 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM227BQ96M60 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM227BQ96M60 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM227BQ96M60 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM227BQ96M60 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM227BQ96M60 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM227BQ96M60 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM227BQ96M60 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM227BQ96M60 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM227BQ96M60 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM227BQ96M60 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM227BQ96M60 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM227BQ96M60 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM227BQ96M60 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM227BQ96M60 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM227BQ96M60 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM227BQ96M60 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM227BQ96M60 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM227BQ96M60 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM227BQ96M60 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM227BQ96M60 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM227BQ96M60 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM227BQ96M60 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM227BQ96M60 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM227BQ96M60 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM227BQ96M60 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM227BQ96M60 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM227BQ96M60 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM227BQ96M60 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM227BQ96M60 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM227BQ96M60 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM227BQ96M60 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms