Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC17Q96LX7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC17Q96LX7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC17Q96LX7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms