Protein–RNA interactions for Protein: Q96LM1

LINC00615, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00615, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00615Q96LM1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC00615Q96LM1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms