Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRIM47Q96LD4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM47Q96LD4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms