Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKNOX2Q96KN3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKNOX2Q96KN3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms