Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC32.86■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC32.85■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
BCANQ96GW7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC32.82■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC32.81■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC32.81■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
BCANQ96GW7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms