Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00526Q96FQ7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00526Q96FQ7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms