Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TVP23CQ96ET8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23CQ96ET8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms