Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC39Q96DD0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC39Q96DD0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms