Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RMDN1Q96DB5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms