Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW5

TUBGCP3, Gamma-tubulin complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP3Q96CW5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBGCP3Q96CW5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms